《方案》要求，各地对申报医疗机构从临床诊疗、科研水平、人才梯队等方面，按照50%、30%和20%的权重进行综合评价，不与医疗机构床位数、门急诊人次、经济收入简单挂钩，不与国家医学中心或区域医疗中心评选挂钩，不授牌。项目单位在重点支持建设领域应有国家临床重点专科，相应专科床位数应不少于80张；中高级职称卫生专业技术人员比例不低于30%，医师研究生学历比例不低于50%；综合医院应为省域内住院医师培训基地，有能力每年开展100人规模的新技术培训，相应科室应能开展国际学术交流，在省域内有技术协作网络，近3年主办过全国或区域性学术会议。对于西藏、青海、新疆等边远地区可适当放宽条件。

国家将对每省份至少安排1个项目，除北京外每省份项目最多不超过6个。国家发改委和国家卫生计生委要求各地抓紧做好项目的遴选、公示和申报工作，并于10月31日前将结果报送两部委。