1936年12月12日，正在上海的孔祥熙得到密报说“西安发生兵变”，于是立即召集上海市市长吴铁城、警备司令杨虎及沪市银钱业商会领袖到家中商议。晚上8时左右，孔祥熙接到南京政府军政部长何应钦打来的电话和电报，得知张学良、杨虎城的主张。

孔祥熙立即通知宋氏兄妹，研究对策。他看到电文中有对蒋“保其安全，促其反省”的字句，知有商谈的余地，遂提出通过和平谈判救蒋的方策，当即获宋氏赞同?？紫槲醺叛Я挤⒊鲆环獯氪潜冉辖魃鞯牡绫ǎ涸诳隙ㄕ叛Я肌鞍?，必有不得已之苦衷”的同时，希望张学良“?；そ楣薄?/p>

13日清晨，被推举为代理行政院长的孔祥熙到达南京，立即会见了何应钦、苏联驻华大使馆秘书鄂山荫、日本总领事须磨。下午，孔祥熙参加国民党中央政治委员会第29次会议，报告关于西安事变的消息和维护金融稳定的情况，还提出“张学良提出的主张，可以商量”，并告诫“讨伐派”：“不要这样急，急狠了，委员长就没命了?！?/p>

几天来，孔祥熙考虑“拟从和谈入手，辅以军事，集各方面之压力，解决事变”，积极联络地方实力派。他发出通电，要各地方当局“以最大之努力与全国上下共策国家之安全”，还分别致电李宗仁、宋哲元、韩复榘、商震、沈鸿烈、阎锡山、刘湘等人，要他们“支持中央”，从各方面对张、杨施加压力。

冯钦哉是杨虎城的17路军24师师长，与孔祥熙有同乡之谊，当时驻防同州。13日开始，孔祥熙便发电报给冯钦哉，要他“设法疏解”“转危为安”，并将西安详细情况密报南京。冯钦哉接到电报后，明确表态准备“痛剿”东北军，“设法收容”17路军。

孔祥熙闻讯后，立即委冯钦哉以“渭北剿匪司令”官衔，还派于右任携带巨款赴陕西，以充实冯部军费。

与此同时，孔祥熙同宋美龄多次商议，决定派端纳先赴西安。15日，端纳由西安飞抵洛阳，向宋美龄电话汇报在西安会晤蒋、张的详细情况。同时，张学良也致电南京政府，邀请孔祥熙和宋美龄同往西安，商讨解决问题的办法。

对此，孔祥熙准备采取“剿抚兼施”“双管齐下”的方针。16日上午，国民党中央执行委员会第30次会议决定下达“讨伐令”?？紫槲鹾土稚怨裾拿逑麓锪恕疤址チ睢币约啊敖溲狭睢薄?/p>

17日晚，孔祥熙发表了《西安事变与戡乱》的演讲，要求“同胞，一致奋起，声罪致讨，拥护政府，迅速削平叛乱”。

此时，中国共产党明确表示主张和平解决事变。12月15日，毛泽东、朱德等15人致电南京国民政府，恳切希望采纳张、杨八项救国主张，变内战为抗战，红军愿“与贵党军队联袂偕行，共赴民族革命之战场”。

12月17日，中共中央派周恩来、秦邦宪、叶剑英等人赴西安，同张学良、杨虎城以及蒋介石进行和平谈判。19日，中华苏维埃中央政府及中共中央发出致孔祥熙等人的通电，提出“反对一切内战，一致抗日”的正确主张。蒋介石也于17日写下“星期六以前万不可冲突，并即停止轰炸为要”的手令，命蒋鼎文回南京交给何应钦，迫使孔祥熙、何应钦等人重新考虑和平谈判的问题。

张学良、杨虎城一再邀请宋美龄和孔祥熙前往西安。但孔祥熙以“医生坚嘱不令飞陕”为由极力推辞。当张、杨两将军表示同意宋子文代替孔祥熙赴西安谈判后，南京政府内又有人认为“宋氏之行为不当”为由加以反对。孔祥熙同宋氏兄妹一起想出一个新的对策。

12月19日，孔祥熙邀孙科、居正、何应钦、叶楚伧、王宠惠等会谈，最后决定“宋子文以私人资格去西安，营救蒋介石”。临行前，孔祥熙还给蒋介石写下一封信，说自己只是“暂代院务”“日日为吾兄祈祷”“三妹在此，有大姐及弟等陪伴”。

12月20日，宋子文自西安返回南京，向孔祥熙汇报同中国共产党代表周恩来会谈的情况。第二天，孔祥熙同意宋美龄、宋子文去西安谈判。

12月25日，张学良、杨虎城释放蒋介石及其随行人员，张学良陪同蒋介石一同返回南京，震惊中外的西安事变得到和平解决?？紫槲跤诮稻┖螅?2月28日通电卸去代理行政院长职务，并说自己在14天的代院期间，“上下一致，共济时艰”“稳定金融，安定地面，维国内之秩序，博友邦之同情”。