据台湾联合新闻网7日报道，考虑到太平岛新建码头，马英九去年年底首度增派两艘新造100吨巡防艇进驻太平岛(舷号PP-10052、PP-10053)，固定配备20机炮。舰船视状况可驶出6公里禁限制水域，执行巡护、护渔任务。不过，其中10052艇今年4月底被调回进行年修后，就没再被派回太平岛，而并入高雄海巡队执勤;近期10053艇也被调回，民进党执政下的“海巡署”将马英九增派的100吨艇全部抽调回台，没有归期。台海巡部门知情官员说，两艘百吨艇是奉令回到高雄“防台风”，避免大浪使舰艇碰撞码头造成损害。该知情官员也透露，太平岛生活艰困，海巡队员赴南沙长期执勤的意愿不高。

《联合报》称，100吨艇也是太平岛首度配备“水炮”的舰艇，进驻后对取缔非法越界捕鱼的大陆或越南渔船的驱离有相当成效与威慑效果。年初有闯入太平岛2.5海里处违法作业捕捞的大型越南渔船，试图冲撞台方警艇后，遭100吨艇发射水炮强力驱离，违法渔民曾向越南媒体抱怨台方“越界执法”，显见100吨艇守岛护渔的威力。

据台湾“中央社”报道，亲民党“立委”周陈秀霞7日上午在“立法院外交及国防委员会”质询时称，美中强势应对南海仲裁案，但媒体却报道“海巡署”部署在太平岛的两艘百吨海巡艇撤回台湾，这样做对不起“国人”。对此，台“防长”冯世宽表示，应该是要防台风而非撤离，不是“不保卫国家”，而是在台风中无法进行战争，所以才撤离。周陈秀霞质问，过去越南就是趁台风来时，台军撤守，而占据敦谦沙洲至今，并积极建设，若越南跟菲律宾趁台风天占领太平岛，台“国防部”有应对对策吗？冯世宽说，“国防部”有应变计划，且太平岛上有驻守“海巡署”官兵，有基本防卫武力。国民党“立委”黄昭顺说，冯世宽早先宣称，若在10年前任“防长”，将会把太平岛搞大10倍，“冯世宽你现在不能示弱”。冯世宽说，在这个敏感时刻，尤其中国大陆正在西沙演习，台方不见得要在这时展现实力。国民党“立委”江启臣质疑，台风是向台湾来而非太平岛，海巡船为何要撤？对此，冯世宽说，相关问题应向“海巡署”厘清。

台“海巡署”7日下午称，南沙太平岛受台风、低气压侵袭或西南气流影响时，可能危及100吨级巡防艇安全，才在台风季节把100吨级巡防艇移调回台作整体规划运用。在南沙太平岛常年配置多艘多功能舰艇及M8艇执勤，并借由南沙“碧海项目”巡护航次或视海域状况延长勤务运行时间等方式，弹性机动调整勤务。

撤走100吨的巡防艇后，太平岛上还有什么船？联合新闻网7日报道说，“海巡署”撤离两艘大型巡防艇，岛上只剩下耐波力差、只能在近岸巡逻的老旧小型船艇，包括M8快艇与原作为河搜使用的多功能巡缉艇。据了解，过去百吨艇未进驻时，岛上还有20吨级巡防艇，现在却只剩没有固定武装的快艇，执勤人员驱离外国渔船要使用手持扩音器与手板广播，船上也没有固定武器，须官兵自行持用轻型自动武器，完全无法和邻近越南占领的敦谦沙洲上所部署的军用巡逻船抗衡，海上执勤执法能力大后退。

有台“外交部”官员透露，对南海仲裁案，“坚持主权、不挑衅大陆与让美国满意”三原则确实存在。据了解，台方关切太平岛被认定为岛还是礁，如果认定是岛屿，当然就没事，但如果将它当成礁岩，台方将会发表严厉回应。

台湾前“立委”邱毅7日接受香港中评社采访时称，看蔡英文对南海的态度，就要先与马英九比较，检视两者差别，马英九对南海态度是明确的、积极的、坚定的，而蔡英文是消极的、模糊的、低调的。蔡英文身边幕僚曾放话有意放弃太平岛，甚至透露要租借给美国当基地用，蔡对这些传言都没驳斥与澄清。蔡英文只考虑一件事，就是放弃南海主权主张的大礼，什么时间点送给美国，政治效益最高？一旦南海仲裁结果不利于中国大陆，否认“U型线”的存在，就是蔡英文放弃南海主权且以租借的方式让美军进占太平岛的最佳时机。

“南海尖锐化，防两岸误判”，台湾《中国时报》7日发表评论称，仲裁案预定12日公布结果，美国、菲律宾和中国大陆相继举行大规模军演，卡在中间的民进党当局面对南海争议本就进退维谷，如今在导弹误射事件后，两岸关系再受冲击，蔡英文应把南海争议和导弹误射事件后续应对，提高到“国安”层级处理，尤其应避免两岸当局因误判对方意图而拉高对抗形势。文章称，两岸目前虽因官方协商机制中断而沟通困难，但经由公开立场的宣示将是两岸高层间接对话、化解误判的重要途径。台方对仲裁结果的回应，必须严守“主权”立场，不能向对岸传递错误讯息，让两岸关系进一步恶化。