《条例》加大了对违法行为的处罚力度。此前，2000年实施的《南京市地下文物?；す芾砉娑ā范云苹档叵挛奈锏奈シㄐ形罡叽σ?万元罚款，违法行为成本极低，不能达到震慑目的，导致很多用地单位在项目建设过程中，即使发现地下文物，也不上报、不停工，甚至不惜破坏地下文物，既免去了支付考古经费，也不用耽误工期。此次制定的《条例》提高了对违法行为的处罚力度，将相关的违法行为罚款额度提高至5万元以上50万元以下，构成犯罪的，由司法机关依法追究刑事责任。建设单位、施工单位、其他相关单位和个人违反本条例规定受到行政处罚的信息，应当依法记入本市信用信息系统。

地下文物属于国家所有。任何单位和个人都有?；さ叵挛奈锏囊逦?，并有权制止和举报破坏地下文物的行为?！短趵分忻魅?，对在地下文物?；すぷ髦杏邢铝星樾沃坏牡ノ换蛘吒鋈?，应当给予表彰或者奖励：及时报告并提供地下文物线索，并经相关文物行政主管部门核查属实的；制止破坏地下文物行为的；在地下文物考古发掘工作中做出突出成绩的；协助追缴流失的出土文物，成绩显著的。

在立法过程中，该《条例》经过多次修改。据介绍，地下文物重点?；で魑娑ǖ暮诵闹贫壬杓?，有力地保障了我市地下文物?；すぷ鳎悸堑轿奈锉；すぷ鞯难有?，应当在条例中予以保留并加以明确。因此，修改新增第五条，继续明确我市地下文物重点?；で姆段В矗禾郎?、薛城史前遗址区；石头城遗址区；六朝、南唐、明代西城及御道遗址区；长干里古居民区及越城遗址区；内秦淮河两岸十朝遗存区；六朝陵墓区；明代开国功臣墓葬区；明代沐英家族墓地区；幕府山、雨花台、铁心桥、西善桥古墓葬群区；其他经市人民政府批准公布的区域。