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组蛋白威力大过DNA 控制生命进程“球局”
或许因为DNA的光环太过璀璨,组蛋白生命活动的控制威力始终“灯下黑”。很早人们便发现,DNA缠绕在组蛋白八聚体上,进而构成染色质,然而,直到1996年前后,一直被认为是结构“边角料”的组蛋白才被发现也坐在掌控生命王朝的“金交椅”上。
犹如“美式普尔”桌球上己方的8枚关键球,组蛋白八聚体此前被认为是坐等击打的“呆球”,事实却是,它们通过位置、角度(甲基化、乙?;┑缺浠?,牵引着DNA这根“球杆”的活动,进而控制生命进程的“球局”。而两位美国科学院院士、表观遗传学领域的开创者大卫·阿里斯和迈克尔·格伦斯坦直击“黑8号”落袋,开创性地证明了基因表达受组蛋白化学修饰影响。
此前不久,他们因此项研究获得2018年拉斯克奖基础医学奖。在2018年诺贝尔生理医学奖公布前,无数的预测版本中,阿里斯和格伦斯坦也一直是名单中的热门人选。错过了今年的诺贝尔奖,下一届得主会不会是他们?了解组蛋白的影响力,或许能有所判断。
不是“杆击球”而是“球引杆”
在真核生物的细胞核中,DNA并非散乱堆放,而是每147个碱基对缠绕一组组蛋白,绕行约1.65圈,为一个重复单元,被称为“核小体”。
就好像乐高玩具的组件,核小体和其他配件一起,通过大量的“拼插”“缠绕”,最终构成松散的染色质或者致密的染色体。
在示意图中,组蛋白经常被画成小球,8个一组成为“线轴”,用来缠绕DNA。人们一直认为组蛋白存在的意义,只是做为DNA的“支架”,并无实际功效。但1996年之后,这种观点开始受到质疑。事实上,越来越多地研究表明,不只调控基因有“开关”的功能,很多非基因的控制元件也在基因调控中发挥关键作用,组蛋白的调控力就是其中之一。
显然,将组蛋白刻画成呆板的“线轴”完全忽略了它“活动”的能力。事实上,它们能退、能进、能守,两位获奖科学家从不同角度证明了组蛋白对DNA的表达有着掌控实力,揭开了一个先前隐藏的基因调控机制。上世纪80年代开始,格伦斯坦就通过对酵母的遗传研究,确立了组蛋白和核小体在活体转录调控和染色体分离中的功能,并证明组蛋白极大地影响活细胞内的基因活动,为理解特定氨基酸在这一过程中的关键作用奠定了基础。而阿里斯在四膜虫中发现了一种酶,能够将特定的化学基团连接到组蛋白中的特定氨基酸上。这种组蛋白修饰酶被证明是一种已知的转录共激活物。
让冷僻的染色质研究热门起来
“我拜访的所有果蝇实验室都对染色质研究毫无兴趣?!卑⒗锼够匾淞松鲜兰?0年代自己博士毕业后研究方向受挫的经历,无奈之下,即使连四膜虫的英文单词怎么拼都还不知道,他仍然接受了同事研究四膜虫的建议。
而格伦斯坦在拉斯克基金会制作的一段视频中说:“我进入这个领域的时候,每个人都在研究基因活性,我想研究组装材料。我不想走别人的路?!?/p>
涉足鲜有人研究的领域,材料获得、研究方法都必须原创。阿里斯在回忆录中写道,除了繁琐海量的在数百种银染凝胶实验中跟踪乙?;泼富钚缘难芯客猓哦踊苟来戳艘阴;泼附耗诩觳饧际?,直接在分离胶内检测酶的活性高低,将实验效率大大提升。
最终,阿里斯勉为其难选择的四膜虫成为研究得以成功的“福星”。四膜虫中的组蛋白乙?;泼概銮捎涤斜绕渌芏嗄J蕉锔吆芏啾兜拿富钚?,很方便做体外酶活实验,如果是在其他细胞中纯化出的酶,未必会有如此结果。
随后,四膜虫中的乙?;泼副环掷牖竦茫⒂肼槭±砉ぱг貉д咴诮湍钢谢竦玫挠凶技せ罟δ艿囊蜃油雌ヅ涑晒?。不久之后,哈佛大学等学者也在哺乳动物体内找到了乙?;泼?,进一步证明组蛋白乙?;曰蜃饔玫摹罢瓶亓Α?,也使得人们认识到这一领域的重要性,科学界对于染色质的研究开始兴旺起来。
组蛋白的掌控力靠“密码”发指令
“人的基因组含30亿个碱基对,像一座延绵的万里长城。去哪个城台垛口去呢?需要特定记号,而担任标记作用的就有组蛋白乙?;浮R砸阴;淼募呛拍芡ü囟ń峁褂虻氖侗穑骺匾蜃影邢蛘心嫉教囟ɑ蜃榍??!痹氚⒗锼褂泄疃妊踅涣鞯那寤笱Ы淌诶詈L谓馐?,首先要有组蛋白的变化,而它们通过甲基化、乙?;然奘纬性睾痛菪畔ⅲ白榈鞍滓阴;褪亲钤缫焕啾谎芯康摹苈搿庵置苈氪莩龅闹噶畹骺刈呕虮泶??!?/p>
在细胞中,组蛋白的工作场所在哪里呢?“组蛋白的翻译后修饰在细胞质与细胞核中都有发生。但是大部分的组蛋白翻译后修饰都是在细胞核中进行的?!敝泄蒲г汗阒萆镆揭┯虢】笛芯吭貉芯吭绷跣斯馐?,有些研究报道某些乙酰基转移酶亦可在细胞质定位,可以乙?;潞铣傻淖榈鞍?,从而影响组蛋白的插入。
寻找参与表观密码解读的“阅读器”(reader)被视为表观遗传学研究基本任务之一。例如,李海涛团队过去五年来,在《细胞》《自然》等杂志发文,先后发现了包括YEATS、PWWP、PHD锌指等在内的一系列“阅读器”结构域特异识别并解读组蛋白修饰的分子基础,揭示出数种新型组蛋白修饰交叉会话机制。
找到了操控发生的“源头”和“场所”后,科学家寻找各种线索汇总到同一个场景中,做到对组蛋白调控的“情景再现”?!翱蒲Ъ颐侵饕羌绦罢倚碌淖榈鞍仔奘渭跋喙匦奘蚊福绦钊胙芯孔榈鞍子肴旧式峁辜盎蜃嫉墓叵??!绷跣斯?。
已在实际应用中发出“回响”
2015年,阿里斯在中国的一次学术演讲中表示,一些组蛋白上发生的错误引起了癌症。而此前,一些遗传性疾病的病因探索中,人们大多将目光放在非组蛋白突变上?!岸榈鞍淄槐湓谌死嘀瘟浦胁艘桓銮痹诹煊?,这是非常有益的?!卑⒗锼顾?。
组蛋白修饰的基因表达调控作用已在实际应用中发出了洪亮的“回响”。随着对组蛋白的理解不断深入,药物研发人员提出了新的癌症治疗方法,如默克公司用于治疗皮肤癌的伏立诺他(Zolinza),就是组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂,已于2016年获得美国食品与药物管理局(FDA)批准上市,更多类似药物也已进入临床试验。
“目前将表观遗传实验发现向临床转化是研究热点,同时也存在很多挑战?!绷跣斯硎?,例如由于表观遗传的复杂性,单个基因的突变可能引起整个基因组范围内表观修饰的变化,从而影响转录、复制、DNA修复等多个细胞过程,因此药物的影响更需要严谨的评估。此外,由于每类表观遗传因子家族蛋白结构相似,抑制剂的特异性也是非常大的挑战。
“此外,将组蛋白的作用纳入到生命进程的解码中,还攻克了多年难以完成的克隆猴工作?!崩詈L嗡?。
相关资料显示,近年来由哈佛大学张毅教授与同济大学高绍荣教授的团队发现,体细胞克隆胚胎发育的主要障碍之一是,克隆胚胎基因组上大量赖氨酸三甲基化的存在。因此,我国完成“中中”“华华”克隆猴培育工作的孙强团队,在克隆过程中注射了去甲基化酶和组蛋白去乙酰化酶抑制剂,大大提高了克隆效率,最终获得成功。
编辑:赵彦
关键词:组蛋白威力 大过DNA 控制生命进程
 
   
 

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