据该部门汇整的统计，此次台风造成的农业损失以台东县最为严重，高达7亿3139万元，屏东县和高雄市的损失位列二、三位，分别达1亿2704万元和1亿877万元。

统计显示，“尼伯特”台风造成台湾农产损失估计为8亿3821万元，农作物被害面积9963公顷，损害程度28%，换算无收获面积2798公顷。受损农作物主要是水果番荔枝，被害面积4198公顷，损失金额达4亿6717万元。此外，畜产损失369万元，渔产损失156万元，林产损失2719万元。

“尼伯特”台风还造成台湾民间农业设施损失1亿3710万元，其中农业设施损失1亿977万元，畜禽设施损失2153万元，渔业设施损失580万元。