另据台湾《中国时报》报道，该区间车是自新竹开出往基隆，根据目击者及伤者的说法，当时列车因即将进站，车速缓慢，突然间，第6节车厢内发生爆炸，然后引燃车厢上方灯具，然后火势延烧至发电机，造成爆炸起火。

目击者描述，起初有3声爆炸巨响，原本滑手机、打瞌睡的乘客都被冒出的浓烟火焰惊醒，惊慌往前面车厢逃窜。之后有乘客拿车厢内的灭火器紧急灭火，因此警消赶到时迅速就扑灭火势，但现场仍弥漫浓烟粉尘，警消随即紧急疏散民众。

据台湾“中央社”报道，一名乘客表示，当时疑似有看到1名年约40岁男子疑似手持长条物品进入车厢后，随即离开车厢；另有乘客指有看到1名男子推着黑色行李箱进入车厢，随即离开。

而警方鉴识小组在列车内发现1个类似长形爆竹的物品，是否有人蓄意放置爆裂物？据了解，由于车厢内没有监视器，且事发突然，乘客当时惊慌失措，未能看清嫌犯容貌，但检警已组成专案小组，并全面追缉嫌犯。警方现已调阅松山火车站附近监视器，从监视画面追查可疑男子，检视是否有背着黑色背包的可疑人士进站上车，因该列车是从新竹发往基隆的区间车，从新竹到案发的松山有21站，警方将逐站地毯式过滤画面清查。

爆炸发生后，台北市消防局立即启动重大伤病患机制，出动消防车辆12辆、救护车辆16辆、人员79名前往救援，并在在松山火车站西侧成立救护站，救出25名伤者。25名伤者分别到三总、国泰、北医、忠孝等6家医院救治。其中有3人伤势较严重，烧烫伤面积超过10％以上，另身上有爆炸造成的撕裂伤。

案发后，台当局“交通部长”贺陈旦、“警政署长”陈国恩、“刑事局长”刘柏良等人赶往现场了解，陈国恩更进入爆炸车厢，检视满目疮痍的现场，指示刑事局鉴识中心采证，发现疑似引燃的爆竹残??；台北地检署主任检察官滕治平率同检察官，指挥警方调阅车站附近的监视器追查。

台铁表示，爆炸前未接获任何恐吓讯息，台铁排除机械故障因素爆炸，研判系人为因素所致。事发后因接近午夜，列车仍正常行驶，而8日全线对号、非对号列车与高铁，在傍晚5时前均因台风停驶，相关单位将趁此机会全面检视车厢与站体安全。